氣相層析串聯式質譜儀(GC-MS/MS)的主要原理是將樣品注入氣相層析儀後，分析物經過高溫揮發成氣相，並由惰性載氣(如氦氣、氫氣或氮氣)送入層析管柱。每種分析物將根據其沸點與極性的不同，在不同時間點從管柱中溶析出來，達到分離效果。當分析物離開GC管柱後，會經由電子或化學離子源引導進入質譜儀，並利用電子束撞擊形成離子化分子及碎片。此時，離子化分子和碎片會加速通過質量分析器，並根據其不同的質荷比被磁場分離。

當一個複雜樣品由GC-MS/MS分離時，會在氣相層析圖上產生許多不同波峰，每個波峰會產生一個獨特的質譜圖，因此可以運用市面上廣泛提供的質譜資料庫來鑑定未知化合物。此外，每個波峰的波峰面積與與對應化合物的濃度成比例，因此也可以應用於目標化合物的定量分析。

GC-MS/MS的資料擷取有多種模式：1)在全掃描(Full Scan)模式下執行，可涵蓋大範圍的m/z質荷比；2)在選擇離子監測(Select Ion Mode；SIM)的模式下執行，能蒐集特定目標質量的資訊；3)在選擇性反應監測(Selected Reaction Monitoring；SRM)模式下執行時，SRM的高度選擇性有助於降低背景離子的干擾，並產生高信噪比，以達到絕佳的偵測能力。

GC-MS/MS可適用於液體、氣體或固體樣品，主要應用範疇包括環境中致癌化合物的測定、藥物代謝產物定量、食品中農藥代謝物的測定、動物用藥等複雜基質樣品的微量分析等。

【聯絡窗口：許育銘博士級研究員 (分機2318)】